Ansgar J. Pommer studierte Biochemie an der Universität Freiburg i. Br. und promovierte 1997 in Proteinchemie an der University of East Anglia, Norwich, U. K. bei Prof. Colin Kleanthous - finanziell unterstützt durch den Wellcome Trust. Der Schwerpunkt seiner Dissertation war die Analyse eines natürlich vorkommenden Antibiotikums.
Nach einem dreijährigen Postdoc in England kehrte er im Jahr 2000 zurück nach Deutschland und begann seine Tätigkeit bei der MelTec GmbH und Co. KG. Hier war Dr. Pommer für den Aufbau und die Leitung des Proteinlabors verantwortlich und arbeitete an der Weiterentwicklung der innovativen Proteintechnologie, einer auf Antikörpern basierenden Fluoreszenzmikroskopie, die es möglich macht, bis zu 100 verschiedene Marker an einem Gewebeschnitt sichtbar zu machen.
Ab 2005 war Ansgar Pommer Mitbegründer der Start-up-Firma SkinSysTec, deren Aufgabe es war, diese Technologie speziell auf dem Gebiet der Dermatologie zu vermarkten. Als Interim CEO und später als CSO war er für die wissenschaftliche Leitung verantwortlich. Als 2009 die Finanzierung der Firma aus gesamtwirtschaftlichen Gründen zurückgezogen wurde, verlagerte Dr. Pommer seinen Schwerpunkt wieder auf die Forschung und die wissenschaftliche Nutzung der Toponomtechnologie an der Hautklinik der Universität in Erlangen. Seine Ergebnisse veröffentlichte Ansgar Pommer als Patente und in zahlreichen hochrangigen Zeitschriften, unter anderem in Nature.

Im September 2016 folgte er dem Ruf an die Rheinische Hochschule Köln und lehrt nun chemische und biochemische Fächer der Molekularen Biomedizin. Seit 2017 obliegt ihm die Studiengangsleitung. „Ich freue mich, mein Wissen und meine langjährigen Erfahrungen sowohl in wissenschaftlicher als auch in wirtschaftlicher Hinsicht weiterzugeben.“ Seit einigen Jahren entwickelt Ansgar Pommer eine wissenschaftliche Kooperation mit dem INES Ruhengeri (Institute of Applied Sciences) in Ruanda weiter.